內窺鏡檢查單元是醫院（或醫生辦公室）中的特定區域，其中執行所有內窺鏡檢查程序。對于這個單元是功能性和有效的，根據美國胃腸內鏡協會（ASGE），某些必須滿足的條件，包括以下內容：

經過適當培訓的內窺鏡醫師和護理人員

功能和充分維護的設備

內窺鏡清潔區域的可用性

接受過培訓以進行心肺復蘇的人員

質量改進計劃到位

開放式內窺鏡檢查是一種系統，旨在抵消穩定患者的內窺鏡檢查費用，而無明顯的合并癥，這些合并癥有明確的上胃腸道內窺鏡檢查指征。 轉診醫師的職責是完全了解患者的病情和接受的內鏡檢查指征。如果患者正在接受抗凝治療或需要進行抗生素預防，則必須通過轉診醫師和內鏡醫師之間的適當溝通來解決這些問題。

根據ASGE的建議，上消化道內鏡檢查的培訓應包括對適應癥，局限性，禁忌癥，替代方案，清醒鎮靜原則以及內鏡檢查結果的正確解釋的理解。建議至少100個上消化道內鏡手術程序，使受訓人員能夠勝任診斷性上胃腸道內窺鏡檢查。

治療性上胃腸道內窺鏡檢查需要進一步的培訓和經驗才能獲得勝任力。ASGE關于獲得各種治療性上消化道內鏡手術能力所需程序數量的建議可通過社會網站獲得。