經鼻EGD（TN-EGD）在彎曲方面具有一定的局限性，這使得難以接近某些胃區域。Rhee等人評估了雙向TN-EGD活檢胃標本的質量和數量是否受到這種限制的影響。  基于直徑和深度（μm）以及組織層（淺表粘膜，深粘膜，肌層粘膜和粘膜下層）的存在來評估樣本量。根據解剖學方向（良好，中等或差），擠壓偽影的存在（無至最小，輕度或中度）和總體診斷充分性（充分，次優或不足）評估標本質量。

在289例TN-EGD胃活組織檢查標本中，33例（11.4％）定向不良，26例（9.0％）顯示存在擠壓，37例（12.8％）顯示整體診斷不足。 在211（73.0％），存在深粘膜，但只有75個標本（26.0％）有肌層粘膜。賁門的后部在樣本數量和質量方面具有最大的局限性，深度最淺，最差的方向和最差的診斷充分性。研究人員建議在使用雙向TN-EGD時特別注意位于賁門后部的胃部病變。

在一項由兩部分組成的研究中，日本研究人員試圖尋找一種良好的清洗液，以對抗TN-EGD用于清洗鏡片的小口徑水射流噴嘴的已知局限性。 Komazawa等人將烏龍茶，大麥茶和蒸餾水作為內窺鏡鏡片的洗滌液進行了比較。在研究的第一部分中，TN-EGD鏡片被豬油污染，然后用三種洗滌溶液中的一種洗滌。當判斷照片的圖像質量時，用烏龍茶洗滌的鏡片導致比用大麥茶或蒸餾水溶液洗滌的鏡片顯著更高的圖像質量。

在該研究的第二部分中，計劃接受TN-EGD的982名患者被隨機分配到其中用三種洗滌溶液之一洗滌內窺鏡鏡片的組。研究人員發現，烏龍茶組的鏡片清潔水平明顯更高，內鏡檢查所需的總時間明顯短于其他兩組。 當比較用于鏡片清潔的洗滌溶液的體積時，與蒸餾水組相比，在烏龍茶組中使用的量明顯更少。根據他們的研究結果，Komazawa等人推薦使用烏龍茶而不是水來清潔TN小口徑EGD鏡片。