針頭部和頸部腫塊的細針穿刺（FNA）有一些局限性。未能建立準確的診斷可能是因為抽樣誤差。在這些情況下，建議重復抽吸，并且可以考慮切除活組織檢查。負責處理，處理（經驗豐富的細胞學技師）和閱讀（細胞病理學家）FNA樣本的人員必須接受過良好的培訓。必須最小化觀察者間的可變性。FNA的準確性隨報告和取樣的組織而變化（參見下面的具體實例）。

由于可能吸入無細胞物質，因此囊性腫塊吸入后的診斷準確性可能尤其可疑。事實上，與實性頸部腫塊相比，囊性頸部腫塊的FNA敏感性較低（分別為73％和90％）。良好證據目前表明，當FNA使用超聲或CT引導，以提高采樣精度實現了最好的結果得以實現。這兩種方式都允許更精確的病變定位，并且可以促進針的更準確定位以在具有中心壞死的病變中吸出囊。通過在椅旁包括細胞學家來染色并在手術終止前預覽載玻片，可以進一步提高準確性。當懷疑淋巴瘤時，這也提供了獲得流式細胞術的額外材料的潛力。

如果對抽吸物的解釋存在任何問題，應推遲進一步治療（例如手術，放療，化療）的決定，直到準確診斷腫塊為止。最后，在適當的條件下使用FNA很重要。FNA補充了臨床診斷，不應被視為徹底的病史和體格檢查的替代品。