任何膽囊切除術，無論采用何種技術（開放式，腹腔鏡或自然腔內腔內窺鏡手術[NOTES]），均可引起以下并發癥：

出血 - 潛在的出血來源包括肝床，肝動脈及其分支和肝門

膽管損傷 - 這些可能導致膽漏，膽管狹窄和膽管炎; 夾子從膽囊管滑落也可能導致膽漏; 然而，膽囊切除術后膽漏的最常見原因是橫切Luschka的導管

NOTES手術特有的潛在并發癥可以從婦科文獻中描述的穹窿鏡檢查（通過后穹窿進入腹腔）的并發癥中推斷出來。在穹窿鏡檢查文獻中描述的一種潛在并發癥是腸或直腸損傷，其發生在約0.25％的病例中。 

從婦科學的角度來看，其他潛在的不良反應包括粘連的形成和先前存在的子宮內膜異位癥的擴散。

盡管不孕癥或性交困難的可能性曾經是一個問題，但子宮僅在通往后穹窿的途中通過并且未受傷，因此對潛在生育的任何影響都不太可能。

從關于子宮切除術的陰道通路的婦科文獻中推斷，性功能的保存與經腹通路的相似。然而，病人被推薦從性交不要為為期2周的。