膠囊內(nèi)窺鏡檢查的成本效益及其對(duì)結(jié)果的影響仍有待最終確定。

法國(guó)的一項(xiàng)隨訪研究評(píng)估了92名接受膠囊內(nèi)鏡檢查的各種適應(yīng)癥患者，發(fā)現(xiàn)在1年時(shí)，陽性和陰性預(yù)測(cè)值分別為100％和94％。 該小組得出結(jié)論，膠囊內(nèi)窺鏡檢查可能成為陰性上下內(nèi)鏡檢查研究后使用的第一個(gè)診斷工具。此外，具有如此高的陰性預(yù)測(cè)值，陰性膠囊研究通常應(yīng)足以指導(dǎo)工作遠(yuǎn)離尋找小腸病理。

在日本和意大利，膠囊內(nèi)窺鏡檢查對(duì)于不明原因的胃腸道出血的研究支持膠囊內(nèi)窺鏡檢查作為一種經(jīng)濟(jì)有效的工具。一項(xiàng)有前景的初步研究將膠囊內(nèi)窺鏡檢查與推進(jìn)式小腸鏡檢查結(jié)果進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)膠囊內(nèi)鏡檢查在診斷能力和陰性預(yù)測(cè)值方面是一種更有效的一線檢測(cè)。 

在不明顯的胃腸道出血中，推進(jìn)腸鏡檢查可以在那些能夠有效成像的區(qū)域提供活檢和內(nèi)鏡治療的能力。這種相對(duì)益處必須與先前對(duì)胃腸道出血評(píng)估為陰性的患者進(jìn)行平衡，膠囊內(nèi)鏡檢查在發(fā)現(xiàn)異常方面更有效，但不能立即進(jìn)行干預(yù)。在腸易激綜合征中，膠囊內(nèi)窺鏡檢查提供有關(guān)肉眼可見病變的信息，但不允許對(duì)組織進(jìn)行組織學(xué)檢查。

膠囊內(nèi)窺鏡檢查提供了比傳統(tǒng)鋇劑研究更多的信息，但可能在IBD患者中存在膠囊滯留的風(fēng)險(xiǎn)并且使疾病變得狹窄。未來的研究也可能定義了兒童膠囊內(nèi)鏡的使用。 膠囊內(nèi)窺鏡也可起到在食管的病癥（例如，Barrett食管）的評(píng)價(jià)的作用， 作為替代上部?jī)?nèi)窺鏡檢查用于上胃腸道出血，并且在門脈高壓和食管靜脈曲張?jiān)u價(jià)。