醫療保險或醫療補助計劃都沒有報銷CT結腸成像，其作為結腸息肉篩查工具的用途得到了更多數據的支持。然而，對于診斷性CT結腸成像的報銷 - 例如，在經歷了不完整的內窺鏡結腸鏡檢查的患者中。

此外，MR結腸成像和CT結腸成像都可能有助于檢測結腸外發現，這可能需要進一步調查，涉及進一步的成本并引起患者的焦慮。迄今為止，尚未對進一步評估MR結腸成像中發現的偶然發現的患者所進行的費用進行研究。然而，已經進行了篩查CT結腸成像的研究，重點是未預期的結腸外發現的臨床和經濟影響。Pickhardt等人最近審查了在2195名患者中進行的非對比篩查CT結腸檢查。在他們的研究中，檢測到204個未發現的具有中等潛在重要性的結腸外結果，133名患者（6.1％）對這些結果進行了進一步的檢查，只有55名患者（2.5％）被診斷出患有至少中等重要性的意外情況（例如，腎細胞癌，膽管癌）。非手術程序的平均費用為31.02美元，外科手術的平均費用為67.54美元。作者總結了他們的發現，他說“明智地處理潛在的結腸外發現是有必要平衡額外檢查的成本與早期發現重要疾病的可能性，因為許多發現將證明沒有臨床后果”。