一個或兩個表面線圈通常與內置的相控陣脊柱線圈一起使用，用于實現整個結腸覆蓋所需的信號接收。根據我們的經驗，最好的方法是使用一組線圈，將表面線圈置于腹部，患者處于仰臥位置，以最大化橫向結腸覆蓋范圍，當患者傾向于最大化覆蓋范圍時腹部下方直腸區。

MR結腸成像有兩種方法：亮腔和暗腔技術。明流式MR結腸成像涉及施用釓螯合物灌注灌腸，而暗腔方法涉及施用水，二氧化碳，室內空氣或（如最近提出的）脂肪。將1.5-2L體積的釓螯合物（1：100）灌腸液灌注到結腸中，用100-150cm的靜水壓力進行明腔MR結腸成像，而相似體積的水，二氧化碳或空氣被灌輸用于暗腔MR結腸成像。

使用明腔腔MR結腸成像的研究人員通常使用雙重定位，以便殘留的糞便或空氣被置換。對于暗腔MR結腸成像，靜脈內施用的造影材料用于區分息肉與殘留的糞便和空氣。然而，即使采用暗腔MR結腸成像（與CT結腸成像一樣），雙重定位有助于促進所有腸段的擴張。為了確保使用明腔MR結腸成像進行安全和最佳的結腸擴張，使用非截面選擇性梯度回波（GRE）序列監測填充過程，每3-5秒獲得一次圖像。使用暗腔MR結腸成像，可以使用半傅立葉采集單次渦輪自旋回波（HASTE; Siemens Medical Solutions，Malvern，Pa）或具有穩態進動序列的真正快速成像來監測填充過程。