可以進行胃鏡檢查以治療一些影響食道，胃和十二指腸的問題。

例如，胃鏡檢查可用于：

停止胃或食道內部的出血，例如由于胃潰瘍或靜脈增大（靜脈曲張）引起的出血

加寬導致疼痛或吞咽困難的狹窄食道 -這可能是由于GORD，食道癌或  對食道的放射療法引起的

清除癌性腫瘤，非癌性生長物（息肉）或異物

提供營養 -胃鏡檢查可幫助醫生在無法正常飲食的情況下將飼管引導至胃中