胃鏡檢查還用于幫助確認（或排除）可疑狀況，例如：

胃潰瘍（有時稱為消化性潰瘍）  –在胃和小腸內壁形成的開放性潰瘍

胃食管反流病（GORD）  –胃酸泄漏回食道

乳糜瀉  –一種常見的消化系統疾病，一個人對食物中的面筋有不良反應

巴雷特食管 – 食管內壁的異常細胞

門靜脈高壓癥–肝臟內部的血壓異常高，導致胃和食道內壁形成靜脈腫脹（靜脈曲張）

胃癌  和 食道癌

除了檢查食道，胃和十二指腸外，內窺鏡（一根細細的，可彎曲的軟管穿過您的喉嚨）也可以用于取出少量組織樣本進行測試。這被稱為活檢。