當需要對鼻咽解剖結構進行診斷，治療或兩者的可視化時，需要進行光纖鼻咽鏡檢查。 

在鼻腔中，纖維鏡鼻咽鏡檢查可以顯現息肉，腫瘤，異物或鼻出血的來源。

在鼻咽部，范圍可以幫助識別疑似腫瘤或腺樣體肥大。

在口咽或下咽部，纖維鼻咽鏡可用于評估異物以及由這種病因的腫瘤和會厭炎，潛在的氣道阻塞阻塞性睡眠呼吸暫停，吞咽困難，發音困難，扁桃體肥大，glossoptosis，或喉癥。它也可能有助于評估血管性水腫的嚴重程度。

來自下圖中顯示的30日齡嬰兒的鼻咽鏡檢查圖像。

目前正在通過鼻咽鏡檢查評估一名30天大的男性嬰兒，該患兒出現上呼吸道喘鳴癥可疑喉炎。

在聲帶中，也可以用纖維鼻咽鏡檢查識別息肉，結節，腫塊和麻痹。