腸道吻合術在手術室進行，手術室應配備以下內容：

麻醉設備，頂燈和手術臺，最好是動力控制的，以確保各種外科手術，電烙術和抽吸系統的平穩和準確定位

如果考慮腹腔鏡切除和吻合術，則適當的腹腔鏡器械和監視器（優選高清晰度）

開胸/胸腔鏡食管切除術和吻合術需要雙腔氣管導管單肺通氣

用于腸吻合的所有類型的縫合材料（可吸收/不可吸收，單絲/復絲）

通常用于腸吻合術的吻合器械，例如橫向吻合術（TA）吻合器，胃腸吻合術（GIA）吻合器和圓形端端吻合術（EEA）吻合器（如果計劃吻合腸吻合術）