膽汁分泌開始于肝臟的膽小管。從這里，膽汁進入終端通道（Hering的運河），隨著它們接近門靜脈通道逐漸擴大。膽汁從區域3中的小葉中心細胞流向區域1中的門脈三聯體。這些導管吻合形成肝門內肝管，而肝內管又成為主要的肝管。

肝門和右肝管和左肝管連接形成肝總管（CHD）。一般來說，右肝管和左肝管連接在肝外; 然而，在5％的人群中，這發生在肝臟內部或膽囊管連接右肝管的位置。在70％的人口中，膽囊管直接進入冠心病。其他可能性包括平行于冠心病的膽囊管或在膽管內側連接之前在膽管前方或后方延伸的膽囊管。

膽總管（CBD）位于小網膜的內層，位于門靜脈前方和肝動脈右側。它通過腹膜后通過十二指腸的第一部分，在胰頭后面，并進入十二指腸的第二部分。CBD然后穿過十二指腸壁以連接主胰管，從而形成Vater的壺腹，并在十二指腸側產生十二指腸乳頭。Oddi括約肌圍繞膽管和胰管，同時它們位于十二指腸壁內。

膽管的動脈供應主要來自右肝動脈。CBD的血液供應來自肝臟和胃十二指腸動脈的分支。這些血管受傷可能導致膽管狹窄。

來自CBD下部的淋巴管排入胰腺頭附近的腺體。膽管其余部分的淋巴引流排空到肝門。

膽囊儲存肝臟產生的膽汁。該系統允許根據脂質溶解的需要將膽汁控制釋放到十二指腸中。膽囊位于右半側下方。它分為位于橫結腸和腹直肌之間的眼底和第九肋軟骨，靠近十二指腸的體，漏斗部和頸部。Hartmann小袋是靠近膽囊頸部的漏斗部的外包裝。當膽結石在該區域受到影響時，它們會阻塞膽囊管并產生膽囊炎或鄰近冠心病的阻塞，這可能導致Mirizzi綜合征。

膽囊的頸部連接到膽囊管，然后膽囊管進入CBD。Heister的螺旋閥由頸部粘膜形成，調節膽汁的流動。

膽囊的動脈供應來自膽囊動脈，膽囊動脈通常是右肝動脈的一個分支。靜脈引流由囊性靜脈提供，通常排空到門靜脈或直接進入肝竇。淋巴引流排空到膽囊頸部附近的淋巴腺中。腹腔軸提供膽囊的交感神經支配; 內臟疼痛是通過這種方式進行的，并且經常被稱為右肋下，上腹和肩胛區域。副交感神經支配起因于迷走神經的兩個分支。

Tubuloalveolar腺體有助于膽囊頸部粘液的產生。Rokitansky-Aschoff竇是表面上皮的內陷，其可以延伸穿過肌層，并且可以是繼發于細菌淤滯和鼻竇內增殖的炎癥的來源。Luschka的導管沿著膽囊的肝表面，并直接進入肝內膽管。這些可能是膽囊切除術后膽漏的來源。

解剖變異是常見的，可能與CBD的損傷有關。必須注意正確識別每個患者的解剖結構; 當解剖結構不清楚時，應進行術中膽管造影以避免潛在的嚴重導管損傷。