計劃進行膀胱鏡檢查或麻醉膀胱鏡檢查并經尿道膀胱腫瘤切除術（TURBT）的患者必須在儀器前記錄無菌尿液。通常根據微觀尿液分析推測無菌，不顯示細菌或白細胞（WBC）。尿培養是理想的，但對于監測膀胱鏡檢查并不總是可行的。

使用儀器進行尿路感染的風險約為1％。因此，作者建議對手術室內患者進行膀胱鏡檢查和靜脈注射抗生素（即頭孢唑啉，慶大霉素）的單劑量氟喹諾酮。過敏可能促使使用替代抗生素治療方案。

根據瓣膜性心臟病的病史，一些患者需要額外的抗生素。美國心臟協會指南建議預防這些患者預防心內膜炎。

在中度風險患者中，在手術前至少30分鐘靜脈內或肌內注射2g 氨芐青霉素（或在手術前至少1小時口服阿莫西林 2g ）。在對青霉素過敏的患者中，可以替代在手術前至少30分鐘完成1-2小時靜脈注射1g劑量的萬古霉素。高風險患者在手術前30分鐘胃腸外注射120 mg慶大霉素，6小時后接受第二劑氨芐青霉素或阿莫西林。

根據臨床情況，假肢患者可能需要額外的抗生素。