TEM可用作直腸息肉的治療手術(shù)，不適合結(jié)腸鏡切除術(shù)。 此外，它可用于選定的直腸癌患者。以下適應(yīng)癥已建議用各種外科學(xué)會，包括結(jié)腸的美國社會和直腸外科醫(yī)師（ASCRS）：

病變小于3厘米; 然而，Khoury等人的一項研究報告使用TEM治療5-8 cm范圍內(nèi)的良性直腸病變 

移動病變

息肉樣病變

局限于腸壁的解剖學(xué)上可見的病變（T1N0）

病變局限于直腸的腹膜外區(qū)域

病變占腸管周長的40％以下; 然而，已報道使用TEM治療巨大圓周直腸腺瘤 

分化良好或中度分化的病變

病變與淋巴血管侵犯無關(guān)

還報道了通過TEM管理直腸陰道瘺管和吻合口裂開管理。

TEM已經(jīng)成為良性腺瘤接受的程序和潛在地可用于直腸的早期癌。

據(jù)報道用TEM治療的腺瘤復(fù)發(fā)率低。 

不建議用TEM明確治療T2或T3直腸病變。

使用透射電鏡作為晚期直腸病變的姑息性手術(shù)對于患有共病癥和播散性疾病且不適合進行更徹底的手術(shù)的患者也是可接受的。