除了與一般手術相關的 那些以外，關節鏡手術幾乎沒有絕對禁忌癥。

如果關節周圍有局部軟組織感染，應推遲關節鏡手術。如果血液循環不良可能會阻礙愈合（特別是在下肢），通常也避免使用關節鏡手術。

關節鏡檢查的一個絕對禁忌癥是嚴重的退行性關節疾病，例如晚期骨關節炎，其中關節軟骨完全剝落（剝離）。在這種情況下，與開放手術相比，使用關節鏡檢查可能弊大于利。

如果關節空間過度縮小超出預期限制，則有必要擔心類似的問題。需要根據具體情況權衡關節鏡手術與開放手術的適當性。