膽囊疾病的潛在長期并發癥，膽囊可能在膽囊和腸之間形成異常的通道或瘺管，以幫助處理肝臟的膽汁。這通常是與膽結石有關的慢性炎癥的并發癥。

其他并發癥可能包括：

腸梗阻

炎癥和疤痕

穿孔（膽囊孔）

腹部細菌污染，稱為腹膜炎

惡性轉化（改變細胞會變成癌性腫瘤）