內鏡消融治療的發展迅速改變了Barrett食管的管理。應通過內窺鏡切除發育不良患者的可見病變，以獲得組織學標本，以便正確分期疾病并評估治療反應。應通過內鏡下黏膜切除術治療粘膜內癌; 深部和側部邊緣的組織病理學檢查將分別決定病變是否適合內鏡治療和進一步治療的需要。徹底根除Barrett食管上皮不僅可以治療已知的病變，還可以治療其他有風險的Barrett上皮細胞的異時或同步病變。可能需要綜合各種方式來實現徹底根除。

需要進行內鏡消融治療的進一步研究，以表征腫瘤形成和Barrett食管的臨床緩解率，長期存活率，埋藏腺體的風險，進展為癌癥的風險以及不同方式的手術相關并發癥。雖然埋藏腺體的重要性尚未完全了解，但它們可能在鱗狀上皮下有發育不良甚至癌癥。因此，需要進一步的研究來闡明埋藏腺體的作用和后果。

消融療法在治療低度不典型增生和非發育不良的Barrett食管中的作用尚未確定，終身監測仍然是受影響患者的當前建議。雖然需要進一步研究消融技術，但食管保留方法顯然將成為高度異型增生和粘膜內癌患者的主要治療方法。