上消化道內窺鏡檢查可用于診斷，有時也用于治療影響消化系統上部的疾病，包括食管、胃和小腸（十二指腸）的起始部位。

醫生可能因以下目的而建議您進行內窺鏡檢查：

研究癥狀。內窺鏡檢查可以幫醫生確定引起消化系統癥狀和體征的病因，例如惡心、嘔吐、腹痛、吞咽困難和胃腸道出血。

診斷。醫生可能會使用內窺鏡檢查收集組織樣本（進行活檢）進而檢測疾病和狀況，例如貧血、出血、炎癥、腹瀉或消化系統癌癥。

治療。醫生可以通過內窺鏡傳遞特殊工具來治療消化系統中的問題，例如，灼燒出血血管以止血、擴大狹窄食管、切除息肉或清除異物。

內窺鏡檢查有時會與其他手術（例如超聲波檢查）結合進行。可將超聲波探頭連接到內窺鏡上，以生成食管壁或胃壁的專門圖像。內鏡超聲檢查還可幫助醫生生成難以觸及的器官（例如胰腺）圖像。新型內窺鏡利用高清視頻來提供更清晰的圖像。

許多內窺鏡允許醫生使用窄帶成像技術，這種技術使用特殊光線以幫助更好地檢測癌前狀況，例如巴雷特食管。