染色內鏡檢查是一種內鏡技術，其中染色被用來突出粘膜的差異，以及在白光下不明顯的增生性和惡性變化。膽道鏡檢查是提高內鏡檢查中各種病理過程的檢出率。染色內鏡通常用于監測Barrett食管的食管，評價結腸息肉，監測炎癥性腸病(IBD)的異常增殖。

對結腸鏡計算機虛擬染色內鏡的初步評估顯示，與染色內鏡相似，不存在后勤困難，也不影響活染料的制備和應用。放大內鏡、光譜學、激光共聚焦顯微鏡和細胞內鏡在慢性潰瘍性結腸炎的診斷和UC監測中起著重要作用。這些技術在Barrett食管中的應用也能更好地檢測發育異常，特別是在無間斷的情況下。