對于有明顯甲狀腺炎史，曾接受過頸部手術或放射治療或疑似惡性腫瘤的患者，禁用經(jīng)口甲狀旁腺切除術。在對甲狀腺切除術的這種方法的描述中，Anuwong還包括牙齒矯正器的存在作為禁忌癥。

其他相對禁忌癥是存在大的甲狀腺結(jié)節(jié)或甲狀腺明顯增大。在一項研究中，如果在術前成像或甲狀腺直徑大于10 cm 時發(fā)現(xiàn)大于6 cm的甲狀腺結(jié)節(jié)，則排除患者。雖然在目前的報告中沒有明確提及，但需要考慮的其他相對禁忌癥包括肥胖和無法實現(xiàn)足夠的頸部伸展（例如，來自之前的頸椎損傷或固定）。

鑒于這種手術技術仍處于早期發(fā)展階段，未來可能會出現(xiàn)額外的禁忌癥。傳統(tǒng)甲狀旁腺切除術的禁忌癥仍然適用。